Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms