Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms