Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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