Protein–RNA interactions for Protein: A6NGA9

TMEM202, Transmembrane protein 202, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM202A6NGA9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM202A6NGA9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms