Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms