Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD54BQ9Y620 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms