Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms