Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHKBQ9Y259 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms