Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms