Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms