Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFMBT1Q9UHJ3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms