Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLKQ9UBT6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms