Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms