Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB6BQ9NRW1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms