Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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