Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLMPQ9H6B4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms