Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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