Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms