Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms