Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF7Q9BWX1 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms