Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms