Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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SEC22CQ9BRL7 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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SEC22CQ9BRL7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SEC22CQ9BRL7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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