Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms