Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
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SAMD8Q96LT4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SAMD8Q96LT4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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