Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLPTM1LQ96KA5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms