Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms