Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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RNF185Q96GF1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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RNF185Q96GF1 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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RNF185Q96GF1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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RNF185Q96GF1 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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RNF185Q96GF1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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