Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHMP6Q96FZ7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHMP6Q96FZ7 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms