Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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MVB12AQ96EY5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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MVB12AQ96EY5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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MVB12AQ96EY5 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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MVB12AQ96EY5 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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MVB12AQ96EY5 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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MVB12AQ96EY5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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MVB12AQ96EY5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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MVB12AQ96EY5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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MVB12AQ96EY5 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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