Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms