Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms