Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-CQ95604 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms