Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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USP9XQ93008 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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