Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRG4Q92954 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms