Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERVK_113Q902F9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms