Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHIPQ8WWQ0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms