Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CLDN19Q8N6F1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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CLDN19Q8N6F1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CLDN19Q8N6F1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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CLDN19Q8N6F1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CLDN19Q8N6F1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CLDN19Q8N6F1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CLDN19Q8N6F1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CLDN19Q8N6F1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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