Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms