Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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USP43Q70EL4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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USP43Q70EL4 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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USP43Q70EL4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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