Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms