Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRAMD4Q6IC98 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms