Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC9A4Q6AI14 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms