Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms