Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms