Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PTPRNQ16849 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PTPRNQ16849 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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PTPRNQ16849 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PTPRNQ16849 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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PTPRNQ16849 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PTPRNQ16849 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PTPRNQ16849 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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