Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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VPS72Q15906 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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VPS72Q15906 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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VPS72Q15906 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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