Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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NEDD8Q15843 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NEDD8Q15843 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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