Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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