Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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TRIP10Q15642 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIP10Q15642 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIP10Q15642 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIP10Q15642 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIP10Q15642 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIP10Q15642 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIP10Q15642 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIP10Q15642 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIP10Q15642 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIP10Q15642 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIP10Q15642 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIP10Q15642 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIP10Q15642 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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TRIP10Q15642 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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TRIP10Q15642 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIP10Q15642 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
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TRIP10Q15642 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIP10Q15642 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIP10Q15642 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIP10Q15642 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIP10Q15642 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIP10Q15642 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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TRIP10Q15642 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIP10Q15642 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIP10Q15642 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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TRIP10Q15642 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIP10Q15642 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIP10Q15642 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIP10Q15642 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIP10Q15642 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIP10Q15642 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIP10Q15642 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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