Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SS18Q15532 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SS18Q15532 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SS18Q15532 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SS18Q15532 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SS18Q15532 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SS18Q15532 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SS18Q15532 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms